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Em Baltimore, o empresário George Usher chega ao seu prédio de escritórios. Ele é vigiado de um bueiro por alguém que então entra no prédio subindo pelo poço do elevador para o sistema de ventilação, e mata Usher removendo seu fígado. O assassinato de Usher foi o mais recente de três e é atribuído ao agente de carreira do FBI Tom Colton (Donal Logue), que pede ajuda a Dana Scully (Gillian Anderson). Colton está perplexo com a falta de pontos de entrada nas cenas do crime e pela aparente remoção dos fígados com as próprias mãos. Fox Mulder (David Duchovny) nota sua semelhança com as séries de assassinatos anteriores de 1933 e 1963. Na cena, ele nota uma impressão digital alongada na ventilação, que ele acha ser semelhante a algumas documentadas nos Arquivos X. Ele conclui que, como cinco assassinatos ocorreram durante as farras anteriores, os investigadores devem esperar para investigar mais.

Em um flashforward para 2010, em Omaha, Nebraska, a cadeira motorizada de uma idosa chamada Marion fica presa na neve. Jimmy McGill, sob o disfarce de Gene Takavic, aparece e oferece sua ajuda, furtivamente cortando os cabos de energia da cadeira, e, posteriormente, oferecendo-se para empurrá-la para sua casa. Ele faz amizade com ela com histórias de seu cão perdido inexistente, Nippy. Marion é revelada como a mãe de Jeff, o taxista que reconheceu Gene como Saul Goodman. Jeff chega em casa e questiona os motivos de Gene. Gene oferece a Jeff a chance de entrar no "jogo" roubando uma loja de departamentos no shopping onde Gene trabalha

Shadows é o sexto episódio da sexta temporada de X-File (Arquivo X), e apareceu pela primeira vez na Fox 22 de outubro de 1993. Foi escrito por Glen Morgan e James Wong e dirigido por Michael Katleman. Esse é um do episódios ao estilo "monster-of-the-week" independente do arco mitológico da série. Dois assaltantes são encontrados mortos em um beco da Filadélfia depois de roubar uma mulher, Lauren Kyte, em uma caixa automático. Mulder e Scully investigam o caso quando chamados por um par de agentes de uma agência desconhecida. Os corpos são encontrados com uma carga elétrica e suas gargantas foram esmagadas por dentro. Enquanto isso, Lauren se reúne com seu chefe, Robert Dorlund, e pede demissão devido à sua dor pela morte do parceiro de Dorlund, Howard Graves, que supostamente cometeu suicídio semanas antes

Quando o corpo de um bebê com problemas físicos é encontrado enterrado em um campo de beisebol, Mulder e Scully investigam uma família suspeita de endogamia. Escrito por James Wong e Glen Morgan, e dirigido por Kim Manners, o teor obscuro e crítico, chegando a fazer referência a Guerra Civil Americana , fez o episódio da série Arquivo X ser proibido de reexibição e impedido de passar em diversos países 

Em Crystal City, Virgínia, sede da empresa de software Eurisko, o fundador Brad Wilczek e o diretor executivo Benjamin Drake discutem sobre cortes. Depois que Wilczek sai, Drake escreve um memorando propondo a paralisação do Sistema Operacional Central (COS), um computador que administra o Edifício Eurisko. Vendo isso através de uma câmera de vigilância, a COS monta uma armadilha e atrai Drake para um banheiro, trancando a porta atrás dele. Drake tenta usar seu cartão-chave para abri-lo, mas ele rejeita o cartão. Quando ele insere uma chave de substituição manual, ele é fatalmente eletrocutado. O agente Jerry Lamana, ex-parceiro de Fox Mulder, se aproxima dele e de Dana Scully para ajudar a investigar o assassinato de Drake.